Projet MARVEL : biosurveillance Marine par ADN enviRonnemental (ADNe) des VErtébrés sur le Long terme (EAU)

Le golfe d'Arabie : la mer la plus chaude du monde 

Les organismes marins du golfe d'Arabie évoluent dans des conditions environnementales extrêmes et uniques au monde : températures de surface dépassant 35 °C en été, salinité parmi les plus élevées des mers ouvertes, faible profondeur. Les impacts des activités humaines locales y sont aussi particulièrement marqués. Ces contraintes font de ce golfe un laboratoire naturel exceptionnel pour l'étude de la biodiversité marine sous stress environnemental.

Contexte et enjeux 

Ce projet vise à caractériser la biodiversité de la faune vertébrée marine mobile (poissons osseux, poissons cartilagineux, mammifères marins, etc) dans les eaux côtières des Émirats arabes unis, en utilisant le metabarcoding de l'ADN environnemental (ADNe) comme outil non invasif de surveillance.

Les zones côtières constituent des écosystèmes d'une richesse exceptionnelle — récifs coralliens, herbiers marins, mangroves — mais sont soumises à des pressions anthropiques croissantes : trafic maritime, pollution marine et dégradation des habitats. La faune mobile y est particulièrement difficile à échantillonner avec les méthodes conventionnelles (pêche scientifique, hydroacoustique, méthodes visuelles).

L'ADNe offre une alternative puissante et non invasive : en filtrant de l'eau de mer, selon des protocoles d'échantillonnage très contrôlés, il est possible d'inventorier les espèces dont l'ADN est présent, sans capturer ni perturber les organismes.

Approche méthodologique  

Les prélèvements sont réalisés en mer à partir de petits navires, par filtration de 30 litres d'eau de surface le long de transects linéaires parcourus à faible vitesse (2–5 nœuds). Les échantillons sont ensuite analysés en laboratoire par une procédure de metabarcoding, permettant d'assigner chaque molécule d'ADN à son taxon d'origine.

• ADN environnemental : Analyse d'un mélange de molécules d'ADN extrait directement de l'eau de mer, sans isolement préalable des organismes.
• Faune ciblée : Poissons osseux, poissons cartilagineux (requins, raies) et mammifères marins présents dans les eaux côtières d'Abu Dhabi.
• Sites d'intérêt : Aires marines protégées, récifs coralliens, herbiers marins, zones portuaires et zones fortement anthropisées.
• Résultats attendus : Inventaires naturalistes par site, indices de biodiversité et comparaisons spatiales ; les évolutions temporelles seront particulièrement suivies sur le long terme.

Objectifs scientifiques  

Le projet produira des inventaires de biodiversité permettant de comparer les assemblages fauniques entre sites et à différentes périodes, afin d'évaluer l'impact des activités humaines sur la faune marine mobile dans les eaux des EAU.

En complément, la construction d'une base de référence de codes-barres ADN d'espèces locales est envisagée pour améliorer l'identification taxonomique des séquences d'ADNe.